Бактериопланктон относится к бактериальным компонентам планктона, который дрейфует в толще воды. Название вида происходит от древнегреческого слова Planktos, что означает "странник" или "бродяга" (Турман, 1997), и бактерии. Латинский неологизм был придуман в 19-ом веке немецким естествоиспытателем, зоологом, микологом и геологом Христианом Готфридом Эренбергом.
Бактериопланктон обитает как в морских, так и в пресных водах. Бактериопланктон занимает спектр экологических ниш в водных системах. Многие из бактериопланктонов редуценты, и получают энергию, потребляя органическое вещество произведенные другими организмами. Этот материал может быть растворенным в водной среде, и доставлен прямо оттуда, или бактерии могут жить и расти в составе с частицами материала, такого как морской снег.
Многие другие виды бактериопланктона являются автотрофными, и получают энергию от любого фотосинтеза или хемосинтеза. Бактериопланктон часто классифицируются как picophytoplankton , и включает в себя цианобактерии групп, такие, как Prochlorococcus и Synechococcus. Бактериопланктон также играют важную роль в становлении экологических путей, таких как фиксация азота, нитрификация, денитрификация, реминерализация и метаногенез.
Как и на другие малые планктоны, на бактериопланктон часто охотятся простейшие представители зоопланктона, и их число также контролируются через инфекции на бактериофаги.